زرد شدن در مرحله پنجه زنی دلایل متفاوتی دارد:
یکی از این دلایل، بقایای کاه و کلشی است که کشاورز قبل از اقدام به کاشت با زمین مخلوط کرده و حضور و تجزیه آنها باعث کاهش منابع نیتروژنی می‌شود و در مرحله پنجه زنی ایجاد زردی در مزرعه می‌کند که حساسیت گیاه را به سرما افزایش می‌دهد.
مورد دیگر پوسیدگی‌های طوقه و ریشه است که آنها هم به واسطه اضافه کردن کودهای دامی، بقایا پوشال و کاه و کلش سال‌های گذشته است که باز هم موجب بروز بیماری‌های قارچی می‌شود و ارتباط طوقه با ریشه‌های سطحی قطع می‌شود و محدودیت جذب آهن و نیتروژن شکل می‌گیرد که بازهم موجب زردی خواهد شد.
یکی دیگر از دلایل زرد شدن هایی که از نوک برگ شکل می‌گیرند که در جو بیشتر و در گندم کمتر است به دلیل بروز سرمازدگی هاست. اگر قبل از بروز سرما پنجه زنی را به صورت کامل نداشته باشیم شاهد زردی هایی خواهیم بود.